Dit zijn de beste boekhoudprogramma’s voor jouw webshop
Op zoek naar de beste boekhoudsoftware voor je webshop of e-commercebedrijf? Dan is het belangrijk om niet alleen naar de maandprijs te kijken. Voor een webshop draait boekhouding vooral om koppelingen: met je webshopsoftware, betaalprovider, bank, verzendsoftware, voorraadbeheer en eventueel je boekhouder of accountant.
Een goed boekhoudprogramma bespaart tijd in plaats van dat het extra werk oplevert. Orders moeten automatisch binnenkomen, betalingen moeten goed worden gekoppeld, btw-aangifte moet overzichtelijk zijn en je wilt snel kunnen zien hoe je webshop er financieel voor staat.
Beste boekhoudsoftware voor webshops: snelle keuzehulp
| Boekhoudpakket | Beste keuze voor | Sterkste punt | Let op |
|---|---|---|---|
| e-Boekhouden | Startende en kleine webshops | Laagdrempelig, voordelig en 15 maanden gratis voor starters | Bij veel orders of complex voorraadbeheer kan later iets zwaarders nodig zijn |
| Moneybird | Moderne webshops die veel willen automatiseren | Fijne interface, sterke automatisering, bankkoppeling en duidelijke pakketten | Let op transactielimieten per pakket; bij webshops wordt Compleet sneller interessant |
| SnelStart | Webshops met voorraad, kassa of handelsprocessen | Sterk bij orderbeheer, voorraad, kassa en processen van webshop tot winkel | Voor e-commerce zijn vooral de hogere pakketten interessant |
| Exact Online | Grotere webshops, B2B, handel en ERP | Breed platform voor boekhouding, handel, voorraad, ERP en accountants | Meer geschikt voor groeiende/complexere bedrijven dan voor simpele starters |
| Visma eAccounting | MKB en ondernemers die met Visma/boekhouder werken | Bekende naam, goede basis voor boekhouden en factureren | Check vooraf of jouw webshopkoppeling goed ondersteund wordt |
Korte conclusie: begin je net met een webshop, dan is e-Boekhouden wat ons betreft de beste start. Wil je meer automatisering en een moderne workflow, kijk dan naar Moneybird. Heb je voorraad, kassa of handelsprocessen, dan wordt SnelStart interessant. Voor grote webshops en complexere e-commercebedrijven komt Exact Online sneller in beeld.
Vergelijk boekhoudsoftware voor webshops
Op deze pagina kun je gebruik maken van onze dynamische vergelijker voor boekhoudsoftware. Daarmee kun je filteren op koppelingen, functionaliteiten en pakketten. Dat is vooral handig omdat de beste keuze sterk afhangt van je webshopsoftware, betaalprovider en administratieproces.
Gebruik de vergelijker vooral om de koppelingen te controleren. Een boekhoudpakket kan nog zo goed zijn, maar als jouw webshopplatform, betaalprovider of verzendsoftware niet goed aansluit, blijf je alsnog veel handmatig werk houden.
Waar moet boekhoudsoftware voor webshops aan voldoen?
Boekhoudsoftware voor een webshop moet meer kunnen dan alleen facturen maken. Bij e-commerce komen orders, betalingen, refunds, voorraad, verzendkosten, betaalproviderkosten en btw-regels samen. Daarom is de juiste koppeling vaak belangrijker dan de laagste maandprijs.
- Webshopkoppeling: orders moeten automatisch of eenvoudig worden ingelezen.
- Betaalproviderkoppeling: betalingen via bijvoorbeeld Mollie, Stripe, PAY. of Buckaroo moeten goed worden verwerkt.
- Bankkoppeling: bankmutaties automatisch ophalen en matchen scheelt veel handmatig werk.
- Btw-aangifte: btw moet goed worden berekend en overzichtelijk klaarstaan voor aangifte.
- Refunds en retouren: terugbetalingen moeten netjes in je administratie terechtkomen.
- Voorraad: bij fysieke producten wil je grip houden op voorraadwaarde, inkopen en verkopen.
- Rapportage: je wilt omzet, kosten, marge en winst makkelijk kunnen volgen.
- Accountanttoegang: je boekhouder of accountant moet makkelijk kunnen meekijken.
1. e-Boekhouden – beste keuze voor startende webshops
e-Boekhouden is wat ons betreft de beste keuze voor startende en kleinere webshops. De software is overzichtelijk, betaalbaar en vooral aantrekkelijk voor starters door de bekende 15 maanden gratis actie.
Voor beginnende webwinkeliers is dat belangrijk. In de eerste maanden wil je je geld liever steken in producten, webshopsoftware, hosting, marketing en voorraad dan in hoge administratiekosten. Tegelijk wil je niet alles in Excel blijven doen, want dan wordt boekhouden snel foutgevoelig en tijdrovend.
e-Boekhouden biedt onder meer boekhouden, factureren, btw-aangifte, bankkoppelingen, scan & herken, rapportages, mobiele app en koppelingen met externe systemen. Voor veel startende webshops is dat meer dan genoeg om professioneel te beginnen.
- Sterk in: prijs, eenvoud, starteractie en basisautomatisering.
- Goed voor: kleine webshops, starters, zzp’ers en ondernemers zonder boekhoudkennis.
- Minder geschikt voor: webshops met veel voorraadlocaties, complexe orderstromen of zware ERP-behoefte.
Ons oordeel: e-Boekhouden is de beste eerste keuze voor kleinere webshops. Je begint voordelig, hebt de basis goed staan en kunt later altijd opschalen of overstappen als je webshop veel complexer wordt.
2. Moneybird – moderne boekhoudsoftware voor automatisering
Moneybird is een sterke keuze voor ondernemers die een moderne, overzichtelijke boekhouding willen en veel waarde hechten aan automatisering. Het pakket is populair bij zelfstandigen en groeiende ondernemers, maar kan ook goed passen bij webshops die hun administratie strak willen inrichten.
Voor webshops is vooral belangrijk dat je let op het aantal transacties en de mate waarin je administratie groeit. Een webshop heeft al snel veel banktransacties, betaalprovideruitbetalingen, inkoopfacturen en bonnetjes. Daardoor kan een lager pakket sneller te beperkt zijn dan bij een gewone zzp’er die maar een paar facturen per maand verstuurt.
Moneybird is sterk als je graag werkt met een nette interface, automatische bankkoppelingen, online betaalmethoden, bonnen verwerken en duidelijke rapportages. Voor veel webshops is vooral het Compleet-pakket interessant zodra je veel transacties verwerkt.
- Sterk in: gebruiksgemak, automatisering, bankkoppeling en rapportage.
- Goed voor: moderne webshops die administratie strak willen automatiseren.
- Minder geschikt voor: webshops die vooral op laagste prijs sturen of veel voorraad/ERP nodig hebben.
Ons oordeel: Moneybird is een sterke keuze als je boekhouding overzichtelijk en modern wilt aanpakken. Let wel goed op het pakket dat bij je aantal transacties past.
3. SnelStart – interessant voor voorraad, kassa en handel
SnelStart is vooral interessant zodra je webshop meer wordt dan alleen online bestellingen verwerken. Denk aan voorraadbeheer, inkoop, orderbeheer, kassa, meerdere verkoopkanalen of een fysieke winkel naast je webshop.
Voor kleine starters is SnelStart niet altijd de meest eenvoudige keuze, maar voor webshops die groeien richting handel en voorraadbeheer wordt het snel relevanter. Pakketten zoals inZicht, inControle en inHandel zijn duidelijk meer gericht op grip op orders, voorraad, verkoop en handelsprocessen.
Heb je een webshop én fysieke winkel? Of verkoop je via meerdere kanalen? Dan is het verstandig om SnelStart serieus te vergelijken met je andere opties, zeker als je voorraad en orderprocessen beter wilt automatiseren.
- Sterk in: orderbeheer, voorraad, kassa, handelsprocessen en samenwerking met boekhouder.
- Goed voor: groeiende webshops, retailers en handelsondernemingen.
- Minder geschikt voor: eenvoudige starters die vooral goedkoop willen beginnen.
Ons oordeel: SnelStart is vooral interessant voor webshops met voorraad, kassa of handelsprocessen. Voor een kleine starter is e-Boekhouden vaak eenvoudiger; voor groeiende handel kan SnelStart logischer worden.
4. Exact Online – voor grotere webshops en complexe e-commerce
Exact Online is een zwaardere oplossing dan e-Boekhouden of Moneybird. Het platform richt zich niet alleen op boekhouden, maar ook op bredere bedrijfsprocessen zoals handel, ERP, order- en voorraadbeheer, CRM en e-commerce.
Daarmee is Exact Online vooral interessant voor grotere webshops, B2B-bedrijven, groothandels en e-commercebedrijven met meerdere processen die samen moeten komen. Denk aan inkoop, voorraad, verkoop, magazijn, boekhouding en rapportage.
Voor een startende webshop is Exact Online meestal te zwaar en te duur. Maar als je webshop groeit naar een serieus bedrijf met meerdere verkoopkanalen, personeel, voorraadlocaties of B2B-klanten, kan Exact juist een logische volgende stap zijn.
- Sterk in: ERP, handel, voorraad, accountantskoppelingen en complexere bedrijfsprocessen.
- Goed voor: grotere webshops, B2B, groothandel en bedrijven met serieuze e-commerceprocessen.
- Minder geschikt voor: kleine webshops die alleen eenvoudige boekhouding nodig hebben.
Ons oordeel: Exact Online is niet de starterskeuze, maar wel een sterke optie voor grotere of complexere e-commercebedrijven.
5. Visma eAccounting – bekende MKB-keuze
Visma eAccounting is een bekende naam in online boekhouden en kan voor MKB-webshops interessant zijn, zeker als je boekhouder of accountant al met Visma werkt. Het pakket richt zich op ondernemers die online willen boekhouden, factureren en hun administratie overzichtelijk willen houden.
Voor webshops is ook hier de belangrijkste vraag: werkt de koppeling goed met jouw webshopsoftware en betaalprovider? Controleer dus vooraf of je shop, bank, betaalprovider en eventuele verzendtools goed aansluiten.
- Sterk in: herkenbare MKB-boekhouding, facturatie en samenwerking met boekhouder.
- Goed voor: ondernemers die al in het Visma-ecosysteem zitten of met een Visma-boekhouder werken.
- Minder geschikt voor: webshops die heel specifieke e-commerce-automatisering nodig hebben.
Ons oordeel: Visma eAccounting kan prima passen, maar check bij webshops altijd eerst de koppelingen. De beste boekhoudsoftware is de software die het minste handmatig werk overlaat.
Boekhoudsoftware koppelen aan je webshop
Voor webshops is de koppeling met je webshopsoftware misschien wel de belangrijkste keuze. Gebruik je Shopify, WooCommerce, Magento, JouwWeb, Wix, CCV Shop of Mijnwebwinkel / Acendy? Controleer dan of je boekhoudpakket de orders automatisch kan inlezen of via een betrouwbare koppeling kan verwerken.
Lees ook onze vergelijking van de beste webshop software. De software waarmee je je webshop bouwt, bepaalt namelijk voor een groot deel welke boekhoudkoppelingen handig zijn.
Werk je met WooCommerce? Dan spelen hosting, performance en plugins ook mee. Goede webshop hosting voorkomt dat je webshop traag wordt door zware koppelingen, cronjobs of veel plugins.
Betaalprovider en boekhouding: let op uitbetalingen en kosten
Een webshopbetaling is administratief vaak ingewikkelder dan één simpele bankbetaling. Je klant betaalt bijvoorbeeld via iDEAL/Wero, PayPal, Klarna of creditcard. Daarna keert je payment service provider een gebundeld bedrag uit, waar transactiekosten en refunds al in kunnen zitten.
Daarom is het handig als je boekhoudsoftware goed aansluit op je betaalprovider. Werk je met Mollie, Stripe, PAY., Buckaroo of een andere PSP? Controleer dan of de transacties, kosten, refunds en uitbetalingen goed in je administratie terechtkomen.
Twijfel je nog over je betaalprovider? Lees dan ook onze vergelijking van payment service providers voor webshops.
Boekhouding, verzending en retouren
Verzendkosten, retouren en verzendlabels horen ook bij je administratie. Zeker bij groei wil je voorkomen dat je handmatig bedragen zit over te typen uit je verzendsoftware.
Gebruik je Sendcloud of een vergelijkbare verzendoplossing? Controleer dan of je verzendkosten, retourlabels en eventuele facturen netjes verwerkt worden. Meer over verzending vind je in onze gids met Sendcloud vragen en antwoorden.
Beste boekhoudsoftware voor kleine webshops
Voor kleine webshops is prijs belangrijk, maar niet het enige. Je wilt vooral voorkomen dat je administratie achteraf een rommeltje wordt. Begin daarom liever met eenvoudige boekhoudsoftware dan met losse Excel-bestanden.
Voor kleine webshops zouden wij vooral e-Boekhouden aanraden. De starteractie maakt de drempel laag, de basisfuncties zijn sterk genoeg voor veel beginnende webwinkels en de software is begrijpelijk voor ondernemers zonder boekhoudachtergrond.
Wil je geld besparen, dan kun je je boekhouding zelf doen. Wil je tijd besparen, kies dan boekhoudsoftware die zoveel mogelijk automatisch verwerkt.
Voor een kleine webshop met weinig orders is e-Boekhouden meestal voldoende. Zodra je meer transacties, voorraad of verkoopkanalen krijgt, wordt het verstandig om opnieuw te kijken of Moneybird, SnelStart of Exact beter past.
Beste boekhoudsoftware voor grote webshops
Voor grotere webshops is de keuze minder simpel. Dan gaat het niet meer alleen om boekhouden, maar om je hele financiële en operationele proces. Denk aan voorraad, inkoop, orderpicking, meerdere verkoopkanalen, retourstromen, marges, magazijn en rapportages.
Voor grotere webshops zouden wij vooral kijken naar SnelStart en Exact Online. SnelStart is interessant als voorraad, kassa en handelsprocessen belangrijk worden. Exact Online wordt logischer als je richting ERP, B2B, groothandel of meerdere bedrijfsprocessen groeit.
Werk je met een accountant of boekhouder? Betrek die dan vroeg in de keuze. Een pakket dat perfect past bij je webshop maar niet bij je accountant, kan alsnog extra kosten en frustratie opleveren.
Stappenplan: zo kies je boekhoudsoftware voor je webshop
- Begin bij je webshopsoftware. Gebruik je Shopify, WooCommerce, Magento, JouwWeb, Wix of iets anders?
- Controleer je betaalprovider. Werkt het pakket goed met Mollie, Stripe, PAY., Buckaroo of jouw PSP?
- Check je bankkoppeling. Automatische bankkoppelingen besparen veel handmatig werk.
- Denk aan btw en buitenland. Verkoop je ook aan België, Duitsland of andere EU-landen?
- Kijk naar voorraad. Heb je eenvoudige voorraad of complexe voorraadstromen?
- Vraag je boekhouder. Je accountant moet bij voorkeur makkelijk kunnen meekijken.
- Bereken het echte maandbedrag. Kijk niet alleen naar het basisabonnement, maar ook naar extra gebruikers, transacties, koppelingen en modules.
- Test met echte data. Gebruik een proefperiode of demo en probeer een paar orders, betalingen en refunds te verwerken.
Veelgemaakte fouten bij boekhouding voor webshops
- Te lang in Excel blijven werken: dat lijkt goedkoop, maar kost snel veel tijd en geeft meer kans op fouten.
- Alleen op maandprijs kiezen: een goedkoop pakket zonder goede koppelingen kan uiteindelijk duurder zijn.
- Betaalproviderkosten vergeten: transactiekosten en refunds moeten correct worden verwerkt.
- Btw bij buitenland onderschatten: verkoop aan andere EU-landen kan extra aandacht vragen.
- Voorraad niet meenemen: voorraadwaarde en inkoop zijn belangrijk voor je cijfers.
- Geen boekhouder betrekken: zeker bij groei is het handig als je administratie professioneel is ingericht.
Onze ideale stack voor een startende webshop
Start je net met een webshop, dan zou je de basis zo kunnen inrichten:
- Webshopsoftware: Shopify, JouwWeb, Strato, WooCommerce of een andere oplossing uit onze webshopsoftware vergelijking.
- Hosting: alleen nodig bij WooCommerce of maatwerk; zie onze gids over webshop hosting.
- Betalingen: Mollie, Stripe, PAY. of Buckaroo via een goede payment service provider.
- Verzending: Sendcloud zodra je regelmatig pakketten verstuurt.
- Boekhouding: e-Boekhouden als starter, Moneybird voor moderne automatisering, SnelStart of Exact bij groei.
- Marketing: Search Console, GA4, SEO-tools en e-mailmarketing uit onze gids met beste marketing tools.
Conclusie: beste boekhoudsoftware voor webshops
De beste boekhoudsoftware voor je webshop hangt af van je fase. Voor startende en kleine webshops vinden wij e-Boekhouden de beste eerste keuze. Het is betaalbaar, begrijpelijk en door de starteractie extra aantrekkelijk.
Wil je meer automatisering en een moderne interface, dan is Moneybird een sterke optie. Groeit je webshop richting voorraadbeheer, kassa, meerdere verkoopkanalen of handel, dan wordt SnelStart interessanter. Voor grotere e-commercebedrijven, B2B of complexere bedrijfsprocessen komt Exact Online sneller in beeld.
Ons advies: kies boekhoudsoftware niet los van de rest van je webshop. Controleer altijd de koppelingen met je webshopsoftware, payment provider, bank, verzendsoftware en boekhouder. De beste boekhoudsoftware is uiteindelijk het pakket dat jou het meeste handmatig werk bespaart.
Partners webwinkelsucces.nl
Zelf gebruik ik e-boekhouden, wat prima software is van Nederlandse makers met bakken aan koppelingen, bij de duurdere partijen voor boekhouden moet je vooral opletten voor de extra kosten. En bekijk de kantoren ook eens van deze partijen: Allemaal luxe, dure panden, dat moet ergens van betaald worden!
Gelukkig zijn er best wat bedrijven in Nederland waar je uit kan kiezen en is inderdaad e-boekhouden een veelgemaakte keuze! Er zijn gelukkig wel meer goedkopere partijen!